Việc triển khai w88.is của Úc để phát hiện và xác nhận phân tử độc tố Shiga sản sinh ra Escherichia coli

Tóm tắt

Một số mẫu thịt của Úc để xuất khẩu sang Hoa Kỳ bắt buộc phải trải qua xét nghiệm vi sinh trong một số trường hợp nhất địnhEscherichia colichủng có thể gây bệnh ở người.E. colisản sinh độc tố Shiga (stx) được gọi là E. coli sinh độc tố Shiga (STEC). E. coli O157:H7 là STEC đầu tiên được Hoa Kỳ yêu cầu để thử nghiệm xuất khẩu vào năm 2007, tuy nhiên, sáu nhóm huyết thanh bổ sung, bao gồm O26, O45, O103, O111, O121 và O145 (thường được gọi là non-O157) đã được thêm vào các yêu cầu thử nghiệm vào năm 2012.

w88.is là phản ứng chuỗi polymerase đa kênh (PCR) gồm 89 mục tiêu, sau đó phân tích phương pháp quang phổ khối ion hóa giải hấp bằng laser - thời gian bay (MALDI-TOF) của các sản phẩm PCR để xác định sự hiện diện của vi khuẩn Escherichia coli sản sinh độc tố Shiga có hại.

Dự án này đã đạt được thử nghiệm chấp nhận tại địa điểm đối với giao thức thử nghiệm w88.is, xác minh hệ thống chất lượng trong phòng thí nghiệm và tạo ra dữ liệu về các mẫu của Úc, điều này sẽ giúp ngành công nghiệp Úc đưa ra lựa chọn sáng suốt về phương pháp thử nghiệm.

Mục tiêu

Dự án này nhằm mục đích xác định rằng dịch vụ w88.is ở Gatton:

• đáp ứng độ chính xác, độ đặc hiệu và độ chính xác đã đạt được trước đây tại phòng thí nghiệm Lincoln, NE USA
• đáp ứng yêu cầu về trình độ
• được thêm vào phạm vi công nhận ISO 17025
• hoàn tất đơn đăng ký tới AOAC để được chấp nhận phương pháp này làm thử nghiệm sàng lọc
• hoàn tất đơn đăng ký lên DAWR để được chấp nhận phương pháp cho mục đích xuất khẩu
• được so sánh về hiệu suất với các phương pháp thử nghiệm phổ biến được sử dụng ở Úc.

Những phát hiện chính

• Công nghệ w88.is phát triển hồ sơ di truyền của vi khuẩn trong mẫu thịt, sau đó so sánh các kết quả đó với cấu trúc di truyền đã biết của các chủng E. coli tham chiếu để xác định và phân biệt các chủng mục tiêu.
• w88.is xét nghiệm hơn 86 dấu hiệu di truyền cụ thể để mang lại kết quả nhanh hơn các phương pháp nuôi cấy thông thường.
• Thử nghiệm w88.is STEC đã nhận được phê duyệt AOAC (#081901) và là phương pháp được FSIS chấp nhận ở Hoa Kỳ.
• w88.is sẽ được cung cấp ở Úc dưới dạng cả bài kiểm tra sàng lọc (Màn hình w88.is) và bài kiểm tra xác nhận (Xác nhận w88.is).
• Việc kiểm tra sàng lọc sẽ diễn ra trong vòng 24 giờ và quá trình xác nhận cũng vậy. 
• Nếu thử nghiệm sàng lọc đã được thực hiện bằng w88.is thì kết quả xác nhận có thể được xử lý trong vòng 2 giờ. Nếu thử nghiệm được sàng lọc ở nơi khác và chạy trên w88.is Xác nhận, kết quả có thể được xử lý sau 24 giờ. 

Lợi ích cho ngành

Có giá trị lớn nhất đối với ngành xuất khẩu thịt của Australia là thử nghiệm có thể giảm thiểu lượng mẫu PP trong khi vẫn duy trì khả năng phân biệt cao trong việc phát hiện các mẫu STEC. w88.is STEC có thể được chạy dưới dạng phương pháp xác nhận một bước, với tỷ lệ chính xác cao đã được chứng minh và tỷ lệ dương tính giả thấp.

Hành động MLA

MLA sẽ tận dụng cơ hội để thông báo cho các phòng thí nghiệm xử lý về tùy chọn thử nghiệm mới này.