Quay lạiR&D chính

Tương tác gen qua môi trường quy định đặc điểm w88 ở cừu Úc

Ngày bắt đầu dự án: 15 tháng 5 năm 2013
Ngày kết thúc dự án: 14 tháng 1 năm 2014
Ngày xuất bản: 01 tháng 5 năm 2014
Trạng thái dự án: Đã hoàn thành
Loài vật nuôi: Cừu
Các khu vực liên quan: Quốc gia
Tải xuống báo cáo

Tóm tắt

w88 là một trong những động lực mang lại lợi nhuận quan trọng nhất trong ngành Merino, nhưng nhìn chung khó đạt được tiến bộ di truyền do khả năng di truyền thấp của các tính trạng mục tiêu nhân giống liên quan đến hiệu suất w88. Không rõ liệu khả năng di truyền thấp là do thiếu độ chính xác trong định nghĩa môi trường hay kiểu hình thực tế hay do các nguồn phương sai khác như hiệu ứng di truyền không cộng gộp hoặc biến thể do tương tác kiểu gen x môi trường (GxE) là quan trọng. 
Nếu tương tác GxE là nguồn biến đổi kiểu hình chính cho các đặc điểm w88, thì chiến lược chọn lọc các kiểu gen mạnh mẽ có thể mang lại hiệu suất ổn định hơn về hiệu suất w88 và khả năng sống sót của cừu. Cách tiếp cận này có thể mang lại hiệu suất sản xuất ổn định và mạnh mẽ hơn, giảm bớt các giai đoạn đệm trong điều kiện môi trường dưới mức tối ưu. Nghiên cứu này nghiên cứu hai khía cạnh. Đầu tiên, người ta đã khám phá sự tồn tại của các tương tác GxE ở cừu Merino trong Đàn Hạt nhân Thông tin. Các phương pháp phân tích khác nhau đã được thực hiện để xác định bộ mô tả môi trường nhằm khám phá xem liệu các định nghĩa khác nhau có tạo điều kiện thuận lợi cho việc phân tách các phương sai di truyền và môi trường cũng như sự tương tác của chúng hay không. 
Xác nhận kết quả từ các phân tích trước đó, người ta đã tìm thấy một số bằng chứng về sự tồn tại của các tương tác GxE nhỏ đối với các đặc điểm w88, nhưng chúng chỉ chiếm tỷ lệ nhỏ trong phương sai kiểu hình. Tất cả các phân tích đều mang lại hệ số di truyền thấp. Khía cạnh thứ hai của nghiên cứu này khám phá phương pháp hồi quy ngẫu nhiên để xác định mức độ mạnh mẽ của hiệu suất đực giống trên các môi trường và sau đó xác định các vùng gen và/hoặc gen cơ bản cho đặc điểm này trong nghiên cứu liên kết rộng về bộ gen (GWAS). Cách tiếp cận này đã được đề xuất bởi Lillehammer et al. (2009) đã phát hiện các gen cơ bản về tính mạnh mẽ của các tính trạng sản xuất sữa. 
Nghiên cứu này đã chứng minh rằng sự biến thiên về hiệu suất w88 của đực giống giữa các môi trường là thấp và do đó, GWAS khó có thể phát hiện được SNP đáng kể có ảnh hưởng lớn đến hiệu suất w88 và bằng chứng thuyết phục về các gen cơ bản. Đúng hơn, kết quả chỉ ra rằng khả năng w88 mạnh mẽ giữa các môi trường ở cừu Merino thuộc INF bị ảnh hưởng bởi một số lượng lớn gen có tác động nhỏ. Thông tin về gen chắc chắn cung cấp nhiều cách tiếp cận hơn để khám phá các tương tác GxE so với các phương pháp di truyền và gen định lượng cổ điển và có khả năng cung cấp các giải pháp hữu hình cho ngành, chẳng hạn như xét nghiệm đánh dấu hoặc giá trị nhân giống gen để đảm bảo độ bền của các tính trạng sản xuất. 
Không có bằng chứng thuyết phục nào về mối liên hệ giữa điểm đánh dấu với tính bền vững của các đặc điểm w88 được phát hiện trong nghiên cứu này. Tuy nhiên, đối với các tính trạng sản xuất trong đó tương tác GxE được chứng minh là quan trọng, phương pháp hồi quy ngẫu nhiên kết hợp với GWAS có thể là một phương pháp hữu ích để xác định các gen có độ bền cơ bản. Ngoài ra, các kỹ thuật đo lường mới về các đặc điểm w88 có thể giải quyết được kiểu hình phức tạp và mô tả các quá trình di truyền cơ bản chính xác hơn những gì hiện có thể thực hiện được với các kiểu hình truyền thống.

Thông tin thêm

Người quản lý dự án: Ứng dụng Richard
Nhà nghiên cứu sơ cấp: CSIRO