Tóm tắt
Dự án này, thông qua nghiên cứu và phát triển, đã đảm bảo cho các nhà sản xuất thịt bò ở Úc có được các công nghệ mục tiêu nhân giống và đánh giá w88 im hạng nhất cũng như các dịch vụ liên quan. Việc triển khai và áp dụng các kết quả đầu ra từ dự án này theo ngành đã góp phần đáng kể vào tốc độ tăng lợi nhuận w88 im nhanh hơn ở bò thịt Úc. Sự cải tiến này đạt được bằng cách đảm bảo ngành công nghiệp thịt bò Australia có hệ thống đánh giá w88 im hiệu quả, linh hoạt và cải tiến, có khả năng thích ứng với nhu cầu thay đổi của người sử dụng và có thể kết hợp kiến thức mới về w88 im, chăn nuôi, thực hành ghi chép, thống kê và tính toán. Ước tính gần đây nhất (tháng 8 năm 2004) về tỷ lệ tiến bộ w88 im của ngành thịt bò đối với lợi nhuận thương mại, được tổng hợp trên các giống, thị trường x hệ thống sản xuất, cho thấy tỷ lệ này đã tăng 1,58 lần khi so sánh các động vật sinh ra trong giai đoạn 1998-2003 với 1992-1998. Mức tăng tiến bộ w88 im ước tính trong năm gần đây nhất (tức là 2002-2003) so với động vật sinh năm 1992-98 là 1,97 lần, rất gần với mục tiêu kế hoạch chiến lược của MLA là tăng gấp đôi (tức là 2,0 lần) tốc độ tiến bộ w88 im vào năm 2006. Điều quan trọng là lợi ích từ R&D của dự án sẽ tiếp tục góp phần tăng thêm tỷ lệ đạt được trong những năm tới khi được áp dụng và hơn thế nữa việc triển khai diễn ra.
Trong suốt dự án, tính toàn vẹn trong hoạt động của hệ thống BREEDPLAN và BreedObject đã được duy trì và các cải tiến đã được thực hiện để đánh giá các giống cụ thể dựa trên yêu cầu phát triển của chúng. Các thông số w88 im mới được ước tính từ cơ sở dữ liệu chất lượng thịt và thịt bò CRC hoàn chỉnh bao gồm hơn 7.500 con vật và các thông số này được kết hợp trong ma trận phương sai/hiệp phương sai của tất cả các giống ôn đới vào năm 2001 và của các giống thích nghi với vùng nhiệt đới vào năm 2002. Ngoài ra, lần đầu tiên, việc ước tính đã được hoàn thành với một ma trận hiệp phương sai w88 im đầy đủ cho 22 tính trạng của giống Hereford/Poll Hereford. Những phát triển này đảm bảo các phân tích BREEDPLAN đang sử dụng các ước tính cập nhật nhất về các thông số quan trọng, do đó đảm bảo các quyết định lựa chọn dựa trên thông tin chính xác nhất có thể. Đầu năm 2003, dự án đã cung cấp cho ngành thịt bò những EBV BREEDPLAN lai giống đầu tiên. Nghiên cứu này được thực hiện bằng cách sử dụng dữ liệu từ dự án EBV đa giống Victoria của MRC và dự án lai tạo giống bò CRC miền Bắc để rút ra những khác biệt về giống và những điều chỉnh cơ sở cần thiết cho việc đánh giá BREEDPLAN giống hiện có của họ.
Một bảng điều chỉnh đơn giản đã được xuất bản cho phép các nhà sản xuất thịt bò Úc so sánh trực tiếp EBV của bốn giống bò Anh (Angus và Hereford) và châu Âu (Limousin và Simmental) nổi bật về đầy đủ các đặc điểm tăng trưởng. Các nhà lai tạo thương mại hoặc các nhà phát triển tổng hợp đang sử dụng sự kết hợp của các giống này giờ đây có thể khai thác đồng thời cả biến thể bên trong và giữa các giống. Những cải tiến đối với phần mềm BreedObject đã dẫn đến sự gia tăng rất lớn trong việc áp dụng công nghệ này ở cả khu vực giống và thương mại. Hai mươi bốn chỉ số $Index tiêu chuẩn về giống đã được phát triển với sự tư vấn của ngành, chiếm khoảng 70% tình hình sản xuất của ngành công nghiệp Úc. Hầu hết các giống hiện nay đều xuất bản các Chỉ số $ một cách thường xuyên thông qua các cơ sở internet BREEDPLAN và trang web BreedObject của họ. Điều quan trọng là giờ đây các chỉ mục có thể được tùy chỉnh hoàn toàn thông qua trang web BreedObject. Điều này mang lại cho các nhà sản xuất cá nhân khả năng phát triển một chỉ số cụ thể cho hệ thống sản xuất và thị trường của riêng họ (hoặc cho khách hàng của họ). Việc tăng cường áp dụng các Chỉ số $ trong ngành đã hỗ trợ rất nhiều cho các nhà tạo giống cây giống và người mua bò đực đưa ra các quyết định lựa chọn với sự nhấn mạnh vào đặc điểm chính xác để sinh lời và do đó đã góp phần làm tăng lợi nhuận chung của ngành.
Phần mềm BreedObject cũng được cải tiến để cho phép tính toán và báo cáo các xu hướng w88 im về lợi nhuận được tổng hợp trên toàn bộ ngành. Xu hướng w88 im trong các chỉ số tiêu chuẩn giống hiện có cho thấy tất cả các giống đang đạt được tiến bộ tích cực đáng kể về Chỉ số $ của chúng và trong hầu hết các trường hợp, tiến trình này đang diễn ra với tốc độ ngày càng tăng. Phần mềm "StockTake" mới, được phát triển trong dự án, cho phép kiểm tra w88 im của một giống hoặc các đàn trong một giống. Người dùng BREEDPLAN (ví dụ: hiệp hội giống hoặc các công ty lớn) có thể sử dụng StockTake để theo dõi những thay đổi theo thời gian trong nhiều biến số của chương trình nhân giống liên quan đến cải tiến w88 im. Phần mềm tạo điều kiện cho việc đánh giá tiến trình w88 im giữa các đàn thông qua việc thiết lập các chỉ số hiệu suất chính (KPI) trong một giống. Đàn có thể được đánh giá dựa trên KPI để cung cấp thông tin có giá trị về hiệu suất tương đối của chương trình nhân giống của chúng so với các đàn khác cùng giống. Khả năng đánh giá tiến bộ w88 im của một đàn so với tất cả các đàn khác trong một giống sẽ hỗ trợ rất nhiều cho các nhà lai tạo thực hiện các cải tiến đối với các chương trình nhân giống nhằm tăng tỷ lệ tiến bộ w88 im trong đàn và giống. Các công nghệ phân tử mới nổi hiện đang cung cấp một số lượng nhỏ các dấu hiệu trực tiếp cho ngành thịt bò Úc. Các thuật toán đã được phát triển trong dự án hiện tại để kết hợp dữ liệu gen trực tiếp cho việc tạo vân cẩm thạch GeneSTAR vào các EBV BREEDPLAN IMF bằng một quá trình "khử hồi quy" các EBV để bao gồm hiệu ứng đánh dấu. Việc thiếu số lượng động vật có kiểu gen trong BREEDPLAN được ghi nhận về đàn và sự không nhất quán trong ước tính về quy mô của hiệu ứng đánh dấu đã ngăn cản việc triển khai toàn ngành quy trình mới này. Việc kết hợp các dấu hiệu sẽ giúp tăng độ chính xác của EBV ở độ tuổi trẻ hơn và bằng cách này hỗ trợ tăng tiến bộ w88 im. Từ góc độ ngành, quy trình được phát triển sẽ đơn giản hóa quá trình chọn lọc bằng cách kết hợp hai nguồn thông tin w88 im.
Dự án đã nâng cao đáng kể khả năng của ngành thịt bò Úc trong việc cải thiện lợi nhuận thông qua việc lựa chọn những loại gia súc có hiệu quả sử dụng thức ăn cao hơn. EBV lượng thức ăn ròng (NFI) đã được phát triển và đưa vào chăn nuôi cho các giống Angus và Hereford. Ngoài ra, một công việc đáng kể đã được thực hiện, kết hợp với dự án MLA BFGEN.100a, để chứng minh tính hữu ích của yếu tố tăng trưởng giống insulin I (IGF-I) như một thước đo tương quan của NFI. Kết quả của công việc này là thử nghiệm IGF-I đã được ngành công nghiệp thịt bò áp dụng và EBV BREEDPLAN NFI hiện kết hợp dữ liệu IGF-I có sẵn của ngành. Người ta hy vọng rằng số lượng bò đực có sẵn để lựa chọn với EBV NFI sẽ tăng lên đáng kể khi ghi nhận IGF-I vì số lượng lớn động vật non có thể được thử nghiệm trong đàn giống. Tuy nhiên, con số cuối cùng sẽ phụ thuộc vào chi phí của xét nghiệm IGF-I. Đánh giá BREEDPLAN mới nhất của Angus minh họa những tác động có thể xảy ra đối với các con số. Nó bao gồm 7.497 bản ghi IGF-I và dẫn đến việc tăng gấp đôi số lượng động vật có NFI EBV có thể công bố so với đánh giá trước đó. Điều quan trọng là việc lựa chọn NFI phải được thực hiện trong khuôn khổ đa đặc điểm (tức là sử dụng BreedObject). Điều này là cần thiết để đảm bảo nhấn mạnh chính xác tính trạng dựa trên tầm quan trọng kinh tế của nó và để đảm bảo rằng các đối kháng w88 im tiềm ẩn với các tính trạng quan trọng khác (ví dụ như màu cẩm thạch và khả năng sinh sản) cũng được giải quyết. Dự án đã phát triển một bộ quy trình mới cho phép sử dụng hồ sơ giao phối từ các kết nối thụ tinh nhân tạo trong đánh giá w88 im về khả năng sinh sản của con cái (tức là số ngày sinh EBV). Một quy trình đã được phát triển để cho phép ghi lại số ngày sinh bê từ dữ liệu giao phối AI được thu thập tại trang trại. Đặc điểm này có thể w88 im và có mối tương quan cao với đặc điểm đẻ hiện tại được ghi nhận từ hồ sơ giao phối của đàn.
Sự phát triển này sẽ nâng cao đáng kể việc đánh giá w88 im các đặc điểm sinh sản của con cái, đặc biệt là ở những giống được sử dụng nhiều AI, thông qua việc tăng số lượng đực giống được đánh giá và tăng độ chính xác trong ngày sinh của chúng đối với EBV sinh bê. Đây là một bước phát triển quan trọng vì khả năng sinh sản của con cái là một đặc điểm thường có giá trị kinh tế tương đối cao, cho thấy đây là một trong những đặc điểm quan trọng hơn của mục tiêu nhân giống. Ngành thịt bò đã đạt được những kết quả đáng kể thông qua việc sử dụng quy trình hồi quy ngẫu nhiên.
Kết quả đầu tiên là sự phát triển của một quy trình phân tích cho phép phân tích hoàn chỉnh hơn 550.000 bản ghi cân nặng để ước tính hàm hiệp phương sai từ sơ sinh đến 8 tuổi. Dự án đã phát triển một quy trình mới để ước tính các thành phần hiệp phương sai cho các mô hình hồi quy ngẫu nhiên sử dụng thuật toán lấy mẫu Gibbs. Kết quả rất quan trọng khác là sự phát triển một phương pháp mới để tính toán hiệp phương sai lỗi dự đoán. Điều này sẽ có các ứng dụng để tính toán độ chính xác gần đúng cho EBV bắt nguồn từ các phương pháp hồi quy ngẫu nhiên và cả cho Chỉ số BreedObject.
Nghiên cứu cho thấy lợi ích của việc sử dụng kỹ thuật hồi quy ngẫu nhiên ở một số cấp độ. Nó xảy ra thông qua việc tăng độ chính xác của EBV, khả năng sử dụng hồ sơ ở mọi lứa tuổi (tức là không cần điều chỉnh độ tuổi) và cũng có khả năng mô tả các đường cong tăng trưởng hoặc tạo ra EBV áp dụng ở mọi lứa tuổi. Để ngành công nghiệp khai thác kỹ thuật mới đòi hỏi một tỷ lệ lớn động vật phải có tối thiểu khoảng 6 bản ghi (ví dụ: trọng lượng) và có thể phát triển các chiến lược tính toán khả thi về mặt thương mại. Cuối cùng, dự án đã thực hiện nghiên cứu quốc tế để phát triển một quy trình mới nhằm giải số lượng lớn các phương trình liên quan đến phân tích BREEDPLAN.
Bộ giải mới có khả năng khai thác nhiều CPU (xử lý song song) và dựa trên thuật toán gradient liên hợp (PCG) được điều hòa trước. Thuật toán PCG hiệu quả hơn thuật toán hiện đang được sử dụng trong BREEDPLAN, cụ thể là liên tục trong quá trình thư giãn. Thuật toán PCG được gọi như vậy vì một bộ điều chỉnh trước được sử dụng để đẩy nhanh quá trình giải. Các điều kiện tiền điều hòa khác nhau có thể làm tăng tốc độ hội tụ. Bộ giải mới sẽ giảm đáng kể thời gian giải cho tất cả các lần chạy BREEDPLAN và sẽ tăng đáng kể tính khả thi của việc chạy các mô hình phức tạp hơn, chẳng hạn như các mô hình cần thiết cho phân tích đa giống trong tương lai.
